Atomsk

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Atomsk è un programma a riga di comando Open Source gratuito dedicato alla creazione, manipolazione e conversione di file di dati per simulazioni su scala atomica nel campo delle scienze computazionali dei materiali. Supporta i formati di file utilizzati da molti programmi, tra cui:

• Software di visualizzazione e analisi: Atomeye, OVITO, VESTA, XCrySDen ;
• Software di calcolo ab initio: ABINIT, Quantum Espresso, VASP, SIESTA ;
• Software classici di simulazione del campo di forza: DL_POLY, GULP, IMD, LAMMPS, XMD ;
• Software di simulazione di immagini TEM: Dr Probe, JEMS, QSTEM.

Atomsk può generare tipi di reticolo comuni come fcc, bcc, hcp ed eseguire trasformazioni elementari: duplicare, ruotare, deformare, inserire dislocazioni, unire più sistemi, creare gemelli, bicristalli e policristalli e così via. Questi strumenti elementari possono essere combinati per costruire e modellare un'ampia varietà di sistemi atomici. Per saperne di più, sei invitato a leggere la documentazione.

Se usi Atomsk nel tuo lavoro, la citazione del seguente articolo sarà molto apprezzata:

• "Atomsk: A tool for manipulating and converting atomic data files"
  Pierre Hirel, Comput. Phys. Comm. 197 (2015) 212-219
  doi:10.1016/j.cpc.2015.07.012

Esempi di sistemi atomici costruiti con Atomsk

Esempi di tipi di reticolo supportati da Atomsk: bcc, fcc, diamond, rock-salt, perovskite, hcp.
Guarda il tutorial (in inglese)

Un policristallo di alluminio
Guarda il tutorial (in inglese)

Una dislocazione della vite nel ferro utilizzando l'elasticità anisotropa
Guarda il tutorial (in inglese)

Una dislocazione del bordo nella perovskite SrTiO₃

Un nanopilastro d'oro
Guarda il tutorial (in inglese)

Un anello di dislocazione in alluminio
Guarda il tutorial (in inglese)

Un nanotubo di carbonio
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