Atomsk

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Atomsk es un programa gratuito de línea de comandos de código abierto dedicado a la creación, manipulación y conversión de archivos de datos para simulaciones a escala atómica en el campo de las ciencias de materiales computacionales. Es compatible con los formatos de archivo utilizados por muchos programas, incluidos:

• Software de visualización y análisis: Atomeye, OVITO, VESTA, XCrySDen ;
• Software de cálculo ab initio: ABINIT, Quantum Espresso, VASP, SIESTA ;
• Software de simulación de campo de fuerza clásico: DL_POLY, GULP, IMD, LAMMPS, XMD ;
• Software de simulación de imágenes TEM: Dr Probe, JEMS, QSTEM.

Atomsk puede generar tipos de redes comunes como fcc, bcc, hcp y realizar transformaciones elementales: duplicar, rotar, deformar, insertar dislocaciones, fusionar varios sistemas, crear gemelos, bicristales y policristales, etc. Estas herramientas elementales se pueden combinar para construir y dar forma a una amplia variedad de sistemas atómicos. Para obtener más información, le invitamos a leer la documentación.

Si utiliza Atomsk en su trabajo, la cita del siguiente artículo será muy apreciada::

• "Atomsk: A tool for manipulating and converting atomic data files"
  Pierre Hirel, Comput. Phys. Comm. 197 (2015) 212-219
  doi:10.1016/j.cpc.2015.07.012

Ejemplos de sistemas atómicos construidos con Atomsk

Ejemplos de tipos de redes compatibles con Atomsk: bcc, fcc, diamond, rock-salt, perovskite, hcp. .
Ver el tutorial (en inglés)

Un policristal de aluminio
Ver el tutorial (en inglés)

Una dislocación de tornillo en hierro usando elasticidad anisotrópica
Ver el tutorial (en inglés)

Una dislocación de borde en perovskita SrTiO₃

Un nanopilar de oro
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Un bucle de dislocación en aluminio
Ver el tutorial (en inglés)

Un nanotubo de carbono
Ver el tutorial (en inglés)

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