atomsk initial.cfg final.xsf
Ceci convertira le fichier initial.cfg (au format CFG) vers le fichier final.xsf (au format XSF).
atomsk fichier.cfg xsf
Ceci convertira fichier.cfg (format CFG) vers fichier.xsf (format XSF).
atomsk fichier.cfg xsf lmp
Ceci convertira fichier.cfg (format CFG) vers fichier.xsf (format XSF) et fichier.lmp (LAMMPS data).
atomsk --create fcc 4.02 Al orient [0-11] [100] [011] cfg
Cet exemple utilise le mode --create pour générer une cellule élémentaire d'aluminium cubique à faces centrées (cfc) avec l'orientation cristallographique X=[011], Y=[100], Z=[011].
Veuillez vous référer à la section sur les options. Plusieurs options peuvent être utiliées consécutivement dans la même ligne de commande, comme dans l'exemple ci-dessous.
atomsk unitcell.xyz -duplicate 20 10 1 -deform x 2 0.33 final.xsf lmp
Dans cet exemple, Atomsk va lire le fichier unitcell.xyz (format XYZ), dupliquer le système pour former une supercellule de dimensions 20x10x1, puis le déformer de 2% suivant X (en utilisant un ratio de Poisson égal à 0.33), et enfin écrire le système final dans les fichiers final.xsf (au format XSF) et final.lmp (LAMMPS data).
Le dossier "examples" fourni avec le programme contient des scripts bash commentés qui utilisent Atomsk pour construire différents systèmes. Les commentaires sont censés être ignorés par l'ordinateur, pas par vous : lisez-les pour comprendre ce que font les scripts. Bien sûr vous pouvez modifier ces scripts pour tester le programme.