-center <indice>
Cette option translate tous les atomes, de sorte que l'atome de l'<indice> donné soit exactement au centre de la boîte.
Si <indice>=0 ou "com", alors tous les atomes sont translatés de sorte que leur centre de masse soit au centre de la boîte.
Par défaut le système n'est pas recentré.
atomsk initial.cfg -center 23 final.xsf
Cette commande va lire le fichier initial.cfg et translater tous les atomes pour que l'atome #23 soit exactement au centre de la boîte. Le résultata sera écrit dans final.xsf.
atomsk initial.cfg -center com final.xsf
Ceci va translater tous les atomes pour que leur centre de masse soit au centre de la boîte.